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技术服务>表观遗传学 |
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DNA甲基化检测
DNA甲基化是最早被发现的修饰途径之一,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,它在维持细胞功能,胚胎发育、生长,癌症产生等诸多方面起到重要的作用。 亚硫酸氢盐反应能够使DNA片段中未甲基化的C与亚硫酸氢钠发生反应,C变成U,经PCR扩增,U变T,而甲基化的C不发生反应,保持不变,从而与未甲基化的C区别开来。目前主要的研究方法也是基于亚硫酸氢盐的处理。艾德科技提供甲基化检测有MSP和BSP方法。
DNA的甲基化主要发生在CpG岛,其甲基化的状态主要是通过亚硫酸盐测序的方法来实现的;样本经亚硫氢酸盐处理后,甲基化的胞嘧啶(C)保持不变,但非甲基化的胞嘧 啶被转化成脲嘧啶,因此在利用该处理产物作为模板的PCR产物中,甲基化的胞嘧啶还是胞嘧啶,但非甲基化胞嘧啶变成了胸腺嘧啶,通过测序可以很容易看出目的片断哪些胞嘧啶是甲基化的,哪些没有,而且还可以对甲基化比例作初步分析。
甲基化特异性PCR(MS-PCR)
在亚硫酸氢盐处理后,即可开展MS-PCR。通常设计两对引物,一对MSP引物扩增经亚硫酸氢盐处理后的DNA模板,而另一对扩增未甲基化片段。若第一对引物能扩增出片段,则说明该检测位点存在甲基化,若第二对引物能扩增出片段,则说明该检测位点不存在甲基化。这种方法灵敏度高,适用性广。
直接测序法(BSP)
是DNA甲基化分析的金标准。它的过程如下:经过亚硫酸氢盐处理后,用PCR扩增目的片段,并对PCR产物进行测序,将序列与未经处理的序列进行比较,判断CpG位点是否发生甲基化。这种方法可靠,且精确度高,能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态。 艾德科技提供PCR产物直接测序和克隆测序。
服务要求
1. 若提供基因组DNA,需≥2ug。
2. 若提供的材料为新鲜组织、血液、细胞等生物材料,请提供足够提取2ug以上基因DNA的材料量。
3. 要检测位点的序列。
服务报告内容
1. 亚硫酸氢盐处理的基因组DNA;
2. 实验报告(包括测序报告)。
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服务编号 |
服务项目 |
内容说明 |
价格 |
周期 |
MSP01 |
DNACpG甲基化检测-BSP法 |
位点克隆测序 |
¥800/样品•位点 |
2-3周* |
MSP02 |
DNACpG甲基化检测-BSP法 |
PCR产物直接测序 |
¥500/样品•位点 |
1-2周* |
MSP03 |
DNACpG甲基化检测-MSP法 |
针对甲基化/非甲基化位点,设计引物,PCR扩增,电泳检测产物 |
¥1200/位点
¥300/样品/位点 |
1-2周* |
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*如遇样品数量多等情况,实验周期可能会延长。
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