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017.更全面的表观遗传学产品线------Active Motif

表观遗传学

表观遗传学是指可遗传的由非DNA序列改变引起的基因表达的变化。引起表观遗传的主要机制有DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA等。研究表观遗传学机制对于癌症研究、分子标记物鉴定、影响因子定位和潜在药物靶点日益重要。

DNA甲基化研究试剂

DNA甲基化(DNA methylation)是最早发现的修饰途径之一,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。在 DNA甲基化转移酶(DNA Methyl Transferases)的催化下,利用S-腺苷蛋氨酸提供的甲基,将胞嘧啶第5位碳原子甲基化,从而使胞嘧啶转化为5甲基胞嘧啶(5-Methylcytosine,5-mC)。最新研究表明,Tet家族蛋白能催化5甲基胞嘧啶转换为5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5-hmC)。有趣的是,来自北卡罗来纳大学医学院生物化学和生物物理学教授张毅(音译)教授实验室发现Tet蛋白能进一步氧化5-hmC产生5-胞嘧啶甲酰(5-formylcytosine,5-fC)和5-胞嘧啶羧基(5-carboxylcytosine,5-caC), 继而会被胸腺嘧啶DNA糖基化酶(DNA glycosylase,TDG)识别并消化。

sam tet_5hmc
5-methylcytosine,5-mC 5-hydroxymethylcytosine,5-hmC 5-Formylcytosine,5-fC 5-Carboxylcytosine,5-caC
四种不同修饰的胞嘧啶

重亚硫酸盐甲基化DNA分析处理试剂盒

bisulfite_conv_2.jpg 检测DNA甲基化的方法有很多种,在众多方法中,研究人员常常会使用到一项技术,那就是重亚硫酸氢盐转化。DNA经过重亚硫酸盐(Bisulfite)处理后,甲基化的胞嘧啶不发生变化,而未甲基化的胞嘧啶变为尿嘧啶。随后用测序、定量PCR和芯片等分析来比较处理和未处理DNA的序列,就能确定哪些碱基是甲基化的。目前市场上有多个厂家提供亚硫酸氢盐转化试剂盒,试剂盒中的试剂和操作步骤经过优化,容易得到更加一致的结果。

供应商 产品名称 规格 编号 试剂盒优点
Active Motif MethylDetector™ 50 rxns 55001 灵敏度:200pg-2ug DNA含DNA纯化柱及人P16基因阳性对照PCR引物,转化率达99%,约需6小时
Millipore CpGenome Turbo Bisulfite Modification Kit 50 rxns S7847 灵敏度:1ng-1ug DNA含DNA纯化柱,转化率达99.9%,仅需90分钟,速度与效果、灵敏度并存

甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR, MSP)试剂盒

甲基化特异性的PCR是一种灵敏度高且操作相对简单的甲基化研究方法。重亚硫酸盐处理DNA后,基因组DNA发生的由甲基化状态决定的序列改变,随后进行引物特异性的PCR。该方法引物设计是关键。MSP中设计两对引物,即一对结合处理后的甲基化DNA链(引物对M),另一对结合处理后的非甲基化DNA链(引物对U)。检测MSP扩增产物,如果用引物M能扩增出片段,则说明检测位点存在甲基化;若用引物U扩增出片段,则说明被检测的位点不存在甲基化。Millipore公司的CpG WIZ ?甲基化特异性PCR试剂盒,提供了目的基因的甲基化和非甲基化引物以及被验证的PCR条件,同时提供对照DNA。

供应商 产品名称 规格 编号
Millipore CPG WIZ OCT-4 AMPLIFICATION KIT 25 assays S7840
Millipore CPG WIZ E-CADHERIN AMPLIFICATION KIT 25 assays S7804
Millipore CPG WIZ SOCS1 AMPLIFICATION KIT 25 assays S7809
Millipore CPG WIZ ER ALPHA AMPLIFICATION KIT 25 assays S7815
Millipore CPG WIZ BRCA1 AMPLIFICATION KIT 25 assays S7830

甲基化DNA分离纯化试剂盒

供应商 产品名称 规格 编号 试剂盒特点
Active Motif MethylCollector™ Ultra 30 rxns 55005 灵敏度:1ng-1ug片段化dsDNA;采用His-MBD2b/MBD3L1蛋白复合物特异性富集甲基化DNA片段;含有阳性对照DNA[human,male genomic DNA(Mse I) digested,20ng/ul]和PCR引物(GAPDH PCR primer unmethylated control,Xist PCR primer methylated control,NBR2 PCR primer methylated control);磁珠方法,操作少于3小时
Active Motif UnMethylCollector™ 30 rxns 55004 灵敏度:10ng-1ug 片段化dsDNA;利用His-CXXC蛋白特异性结合非甲基化的CpG,包含阳性对照DNA(MseI digested human, male genomic DNA)和PCR primers(GAPDH PCR Primer Mix unmethylated control, Xist PCR Primer Mix methylated control),磁珠方法,操作少于3小时
Active Motif Hydroxymethyl Collector™ 25 rxns 55013 灵敏度:5ng-2.5ug片段化dsDNA,b-glucosyltransferase在5-hmC上转移一个Glucose基团,利用streptavidin磁珠来捕获和富集经过biotin修饰的Glucose基团,包含5-hmC Control DNA(APC基因的338bp片段,该区域25%的C发生羟甲基化)及APC PCR primer mix,磁珠方法,操作少于4小时
Active Motif hMeDIP Assay 10 rxns 55010 利用5-hmC特异性抗体从5-mC和非甲基化DNA中分离含5-hmC的dsDNA和ssDNA,试剂盒包含非甲基化DNA control,5-mC DNA control,5-hmC DNA control以及PCR primers。检测范围:100ng-1ug片段化DNA
Active Motif MeDIP Assay 10 rxns 55009 利用5-mC特异性抗体从5-mC和非甲基化DNA中分离含5-mC的ssDNA,包含阳性对照DNA(MseI digested human,male genomic DNA)和ZC3H13 PCR primer pair
MilIipore CpG MethylQuest™ DNA Isolation Kit 30 rxns 17-10035 灵敏度:1ng-1ug片段化dsDNA采用GST-MBD2b蛋白预包被的磁珠,特异性富集甲基化DNA片段,简单快速,只需2小时

  Methylation at: DNA Enriched: Magnetic
Beads
Capture
Method
Target
  CpG non-CpG ssDNA dsDNA
Hydroxymethyl Collector™ - Chemical 5-hmC
MethylCollector™Ultra - - Protein 5-mC
UnMethylCollector™ - - Protein 5-C
hMeDIP Antibody 5-hmC
MeDIP - Antibody 5-mC
甲基化DNA分离纯化试剂盒选择指南

DNA甲基转移酶(DNMT)活性/抑制剂分析试剂盒

以高灵敏度的ELISA为基础,利用甲基化CpG結合域(MBD)对甲基化DNA的高亲和力,以富含CpG的DNA底物(substrate)检测DNA甲基化转移酶的活性。96孔板设计,适用于高、低通量的实验。

供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif DNMT Activity / Inhibition Assay 1 x 96 rxns 55006
Active Motif Recombinant DNMT1 protein, active 10 µg 31335

DNMT_flow_chart_v3
DNA甲基转移酶(DNMT)活性/抑制剂分析试剂盒检测原理

DNA甲基化相关抗体

供应商 产品名称 规格 编号 应用
Active Motif 5-Hydroxymethylcytidine (5-hmC) antibody (pAb) 100 µg 39769 DB,IF,IHC,MeDIP
Active Motif 5-Methylcytosine (5-mC) antibody (mAb) 50 µg 39649 FACS,IHC,IP,MeDIP
Active Motif 5-Carboxylcytosine (5-caC) antibody (pAb) 100 µl 61225 DB,IF
Active Motif 5-Formylcytosine (5-fC) antibody (pAb) 100 µl 61223 DB,IF
Active Motif DNMT1 antibody (mAb) 100 µg 399204 ChIP,IHC,IP,WB
Active Motif DNMT3A antibody (mAb) 100 µg 39206 ChIP,IF,IHC,WB
Active Motif DNMT3B antibody (mAb) 100 µg 39207 ChIP,IF,IP,WB
Genetex Tet1 antibody 100 µl GTX125888 WB
Genetex TET1 antibody [N3C1], Internal 100 µl GTX124207 ICC/IF, IHC-P, WB
更多DNA甲基化相关抗体,可与艾德科技010-52406250联系。

其他相关产品

供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif β-Glucosyltransferase 500 units 55012
Active Motif PvuRts1I restriction enzyme 50 units 55011
Active Motif Fully Methylated Jurkat DNA 10 µg 55003
Active Motif Jurkat genomic DNA 10 µg 55007
Active Motif Methylated DNA Standard Kit 3 x 2.5 µg 55008
Millipore CpGenome Universal Methylated DNA 10 µg S7821
Millipore CpGenome Universal Unmethylated DNA set 10 µg S7822

组蛋白/染色质研究试剂

在表观遗传学的研究内容中, “组蛋白密码”是其重要部分。核心组蛋白上的共价修饰,在真核细胞的染色质结构重塑和基因表达调控方面起重要作用。

核蛋白提取试剂盒

Nuclear Extract Kit是一种从哺乳动物组织或细胞中制备细胞核、细胞质或全细胞提取物的试剂盒。其高品质的提取物,可用于TransAM™ Kits、Gel-shift、Western blot、DNA足印法(Footprinting)或作为转录因子纯化的样品制备。Nuclear Extract Kit不需进行试剂优化,能保证获得高回收率的抽取蛋白。其详细的操作步骤能确保抽提物不受来自其他细胞成分的蛋白污染。

供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif Nuclear Extract Kit 100 rxns 40010
Active Motif Nuclear Extract Kit 400 rxns 40410

组蛋白纯化试剂

Active Motif的组蛋白纯化试剂让您可以轻松的从任何细胞系或组织样品中分离纯化核心组蛋白,同时仍保留转录后修饰如乙酰化,甲基化和磷酸化等。由组蛋白纯化试剂盒纯化所得的高纯度组蛋白可适用于多种下游实验应用与功能研究。

供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif Histone Purification Kit 10 rxns 40025


ChIP实验的一般过程

染色质免疫共沉淀试剂盒

染色质免疫沉淀(ChIP)是研究蛋白质-DNA相互作用的一项强大技术,广泛用于多个领域的染色质相关蛋白的研究(如组蛋白及其异构体,转录因子等),特别适用于已知启动子序列或整个基因位点的组蛋白修饰分析研究。这项技术采用特定抗体来富集存在组蛋白修饰或者转录调控的DNA片段,通过多种下游检测技术(定量PCR,芯片,测序等)来检测此富集片段的DNA序列。


供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif ChIP-IT® Express 25 rxns 53008
Active Motif ChIP-IT® Express Enzymatic 25 rxns 53009
Active Motif ChIP-IT® Express HT 96 rxns 53018
Active Motif Re-ChIP-IT® 25 rxns 53016
Active Motif Ready-to-ChIP HeLa Chromatin 10 rxns 53015
Active Motif Ready-to-ChIP NIH/3T3 Chromatin 10 rxns 53021
Active Motif RNA ChIP-IT® 25 rxns 53024
Millipore CHROMATIN IP (CHIP) ASSAY KIT 22 Assays 17-295
Millipore EZ CHIP KIT 22 ASSAYS 22 Assays 17-371
Millipore EZ-Magna ChIP™ A Chromatin Immunoprecipitation Kit 22 Assays 17-408
Millipore EZ-Magna ChIP™ G Chromatin Immunoprecipitation Kit 22 Assays 17-409
Millipore Acetyl-HistoneH3 ChIPAssay Kit 22 Assays 17-245
Millipore Acetyl-HistoneH4ChIPAssay Kit 22 Assays 17-229
Millipore EZ-Magna RIP Kit 12 rxns 17-701
Millipore Magna RIP Kit 12 rxns 17-700

trans-am_flowchart
转录因子活性分析试剂盒检测原理

转录因子活性分析试剂盒

转录因子为DNA结合蛋白,严格控制基因的表达。转录因子一般由两个不同的结构域组成,一个结构域与特定DNA序列有高的亲和力,另一个结构域具转录活性。磷酸化特定氨基酸残基或加工结合的抑制性蛋白,可以激活转录因子。研究和定量分析转录因子活性对于研究细胞分化、免疫应答、炎症反应和多种疾病状态等细胞功能至关重要。

供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif TransAM™ c-Myc 1 x 96 rxns 43396
Active Motif TransAM™ ER 1 x 96 rxns 41396
Active Motif TransAM™ GATA-4 1 x 96 rxns 46496
Active Motif TransAM™ GR 1 x 96 rxns 45496
Active Motif TransAM™ IRF-3 (Human) 1 x 96 rxns 48396
Active Motif TransAM™ MyoD 1 x 96 rxns 47196
Active Motif TransAM™ p53 1 x 96 rxns 41196
Active Motif TransAM™PPARγ 1 x 96 rxns 40196
Active Motif TransAM™ STAT3 1 x 96 rxns 45196
Active Motif TransAM™ T-bet 1 x 96 rxns 51396
Millipore EZ-TFA NFkB p65 96 assays 70-520
Millipore EZ-TFA c-jun 96 assays 70-540
Millipore EZ-TFA AP-1 Family 96 assays 70-550
Millipore EZ-TFA c-fos Colorimetric 96 assays 70-545
Millipore EZ-TFA NFkB p50 Colorimetric 96 assays 70-515

蛋白修饰及检测试剂盒

许多蛋白的功能和活化都受到翻译后修饰的调控,一些功能基团的增减可导致蛋白构象的改变,从而使其能够与其他蛋白结合。磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化以及SUMO化参与调节蛋白的活性以及信号转导.


供应商 产品名称 规格 编号
Active Motif SUMOlink™ SUMO-1 Kit 20 rxns 40120
Active Motif SUMOlink™ SUMO-2/3 Kit 25 rxns 40220
Active Motif Histone H3 acetyl Lys9 ELISA 1 x 96 rxns 53114
Active Motif Histone H3 trimethyl Lys27 ELISA 1 x 96 rxns 53106
Active Motif Histone Demethylase Assay (Fluorescent) 48 rxns 53200
Active Motif Histone Acetyltransferase Assay Kit (Fluorescent) 1 x 96 rxns 56100
ENZO Ubiquitinylation Kit 50 x 50μl rxns BML-UW9920-0001
ENZO SUMOylation Kit 20 assays BML-UW8955-0001
ENZO Lysine-specific Histone Demethylase 1 fluorimetric drug discovery kit 96 assays BML-AK544-0001
ENZO Fluor-de-Lys® HDAC fluorometric activity assay kit 96 assays BML-AK500-0001
ENZO Color-de-Lys™ HDAC colorimetric activity assay kit 96 assays BML-AK501-0001
ENZO Fluor-de-Lys®-Green HDAC fluorometric activity assay kit 96 assays BML-AK530-0001
ENZO Fluor-de-Lys® HDAC1 fluorometric drug discovery assay kit 96 assays BML-AK511-0001
ENZO Fluor-de-Lys®-Green HDAC2 fluorometric drug discovery assay kit 96 assays BML-AK512-0001
ENZO Fluor-de-Lys® HDAC6 fluorometric drug discovery kit 96 assays BML-AK516-0001
ENZO Fluor-de-Lys® HDAC8 fluorometric drug discovery kit 96 assays BML-AK518-0001
ENZO Fluor-de-Lys® HDAC3/NCOR1 fluorometric drug discovery kit 96 assays BML-AK531-0001
ENZO Fluor-de-Lys® SIRT1 fluorometric drug discovery assay kit 96 assays BML-AK555-0001
ENZO Fluor-de-Lys® SIRT2 fluorometric drug discovery assay kit 96 assays BML-AK556-0001
ENZO Fluor-de-Lys® SIRT3 fluorometric drug discovery assay kit 96 assays BML-AK557-0001
ENZO Fluor-de-Lys® HDAC fluorometric cellular activity assay kit 96 assays BML-AK503-0001
ENZO LSD1 Fluorimetric Drug Discovery Kit 96 assays BML-AK544-0001
ENZO Acetyltransferase activity kit 96 wells ADI-907-026
Cayman Methyltransferase Fluorometric Assay Kit 96 wells 700150-96
Cayman HDAC Cell-Based Activity Assay Kit 96 wells 600150-96
Cayman SIRT1 Direct Fluorescent Screening Assay Kit 96 wells 10010401-96

组蛋白及相关抗体

组蛋白及组蛋白修饰相关抗体,全面提供,详细产品信息可与欣博盛公司联系。

EpiShear™多样品超声破碎仪(Multi-Sample Sonicator)

特点:
1.一次可处理8份样品(20 µl - 1.2 ml sample per vial)
2.可用于ChIP和DNA甲基化研究中染色质或DNA的断裂
3.也可用于细胞破碎,RNA剪切或其他匀浆处理
4.可搭配冷却器Chiller一起订购

供应商 产品名称 电压 编号
Active Motif EpiShear™ Multi-Sample Sonicator / Chiller 230V 53063
Active Motif EpiShear™ Multi-Sample Sonicator 230V 53066
Active Motif EpiShear™ Thermoelectric Chiller 100V-240V 53068

其他相关产品

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Active Motif ChIP DNA Purification Kit 50 rxns 58002
Active Motif ChIP-IT® Control qPCR Kit – Human 5 rxns 53026
Active Motif ChIP-IT® Control qPCR Kit – Mouse 5 rxns 53027
Active Motif ChIP-IT® Control qPCR Kit – Rat 5 rxns 53028
Active Motif ChIP-IT® Control Kit – Human 5 rxns 53010
Active Motif ChIP-IT® Control Kit – Mouse 5 rxns 53011
Active Motif ChIP-IT® Control Kit – Rat 5 rxns 53012
Active Motif Ready-to-ChIP HeLa Chromatin 10 rxns 53015
Active Motif Ready-to-ChIP Hep G2 Chromatin 10 rxns 53019
Active Motif Ready-to-ChIP K-562 Chromatin 10 rxns 53020
Active Motif Ready-to-ChIP NIH/3T3 Chromatin 10 rxns 53021

EPIGENETICS LIBRARY

表观遗传化合物库包含多种小分子化合物,具有已知的调节表观遗传修饰相关分子的活性,如HDACS,SIRTS, Lysine demethylases, HATs, Histone methyltransferases, DNA methyltransferases等。每种化合物以10mM的浓度溶于DMSO,以96孔板形式提供。该化合物库是研究化学基因组学,药物研发及其他药理学应用的一种非常有用的工具。

供应商 产品名称 化合物种类 规格 编号
ENZO Epigenetics library  43种 500µl/well BML-2836-0500
ENZO Epigenetics library 43种 100µl/well BML-2836-0100
Cayman Epigenetics Screening Library (96-Well) 54种 50µl/well 11076-50
Cayman Epigenetics Screening Library (96-Well) 54种 100µl/well 11076-100
Cayman Epigenetics Screening Library (96-Well) 54种 500µl/well 11076-500

端粒酶活性检测

端粒是真核细胞染色体末端的一段特殊序列,由上千个6碱基重复序列(TTAGGG)组成。在体细胞中,随着细胞的分裂,端粒长度会变短。端粒酶是基本的核蛋白逆转录酶,在细胞染色体复制过程中,能够以自身RNA为模板,在染色体3’末端合成重复序列,维持端粒的长度。端粒酶的活性端粒酶在正常人体组织中的活性被抑制,但是在一些“不死细胞”如肿瘤细胞、生殖细胞中则具有很高的活性,补偿DNA复制导致的端粒缩短从而维持端粒长度的稳定。因此可以假设端粒长度可能起到“有丝分裂钟”的作用,来可作为测量细胞分裂的次数的标志,最终作为细胞衰老和凋亡的信号。因此,检测细胞中端粒酶的活性对干细胞、肿瘤生物学的研究具有很重要的意义,已有研究表明,在20多种肿瘤细胞中,80%以上可以检测到高端粒酶活性。

* *利用端粒酶在体外可以以其自身RNA的模板区为模板,在适宜的寡核苷酸链的末端添加6个碱基的重复序列的原理,1994年Kim建立了基于PCR基础上的端粒重复序列扩增法(telomeric repeat amplification protocol, TRAP)。TRAP主要原理如下:首先合成一个18nt的TS做上游引物,端粒酶结合TS末端的GTT并合成AGGGTTAG,然后每经过一次转位合成一个ggttag的6碱基重复序列,端粒酶灭活后,加入一个24nt的CX做下游引物,经过多次变性-退火-延伸,扩增端粒酶延伸产物。然后对PCR产物使用不同的方法进行检测,从而达到检测端粒酶活性的目的.

Millipore公司的TRAPeze®系列端粒酶检测试剂盒采用了一种缓冲液、两种酶的 PCR 系统,能高灵敏地在体外检测哺乳动物细胞的端粒酶活性,适用于细胞和组织提取物。该系列产品基于TRAP的原理,结合不同的PCR产物检测方法,方便研究者根据自己的需求选择合适的产品:

TRAPeze® Telomerase Detection Kit:将PCR产物进行非变性凝胶电泳,然后使用荧光染料SYBR® Green对凝胶进行染色。操作简单、需要时间短,但不能进行定量检测。

TRAPeze® XL Telomerase Detection Kit在TRAPeze® Telomerase Detection Kit的基础上,加入了创新的Amplifluor® 荧光能量转移标记引物,可通过直接在PCR管中测定荧光强度来定量检测端粒酶活性,无需跑胶和ELISA等后续操作,非常简单方便。因为不需要打开PCR管盖,最大程度避免了污染的可能性,将假阳性降到最低。(跑胶后无需加荧光染料就能看到条带)

TRAPeze® RT Telomerase Detection Kit:Realtime-PCR方法定量检测。

供应商 产品名称 规格 编号
Millipore TRAPeze® Telomerase Detection Kit 112T S7700
Millipore TRAPeze® XL Telomerase Detection Kit 112T S7707
Millipore TRAPeze® RT Telomerase Detection Kit 112T S7710
Millipore TRAPeze® Telomerase Positive Control Cell Pellet 1 vial S7700
Millipore TRAPeze® 1X CHAPS Lysis Buffer 10 ml S7705

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