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技术服务>分子生物学 |
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细菌16S rDNA菌种鉴定
16S rDAN是编码原核生物核糖体小亚基rRNA(16S rRNA)的基因。 长度约为1500pb,是细菌分类学研究中最常用、最有用的"分子钟16S rRNA其大小在1,500 bp左右,所代表的信息量适中,因此是进行分类研究的理想材料。利用16S rDNA两端的引物PCR扩增未知菌株的16S rRNA基因,并进行DNA测序,与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,判定细菌种类,将细菌划分到属或种。
艾德科技提供扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1,500 bp,进行进行全序列测序,BLAST,以得到较为全面的种属特异性信息,确定样品的种类。
服务要求
1. 请提供基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面。
2. 基因组DNA的浓度≥10 ng/μl,总体积≥20 μl,且无明显降解;平板或斜面应长有分离的单菌落。
3. 由于革兰氏阳性细菌或厌氧菌、放线菌等特殊菌株,请在服务委托书中加以说明。
4. 如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。并建议克隆多个测序鉴定。
服务基本流程
1. 艾德科技进行引物设计合成;
2. PCR扩增16S rDNA;
3. PCR产物纯化;
4. 测序,序列比对分析。
服务报告内容
实验报告包括PCR产物照片、NCBI序列比对鉴定结果、测序报告、序列碱基图、以及剩余模板(艾德科技可保存1个月);
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服务编号 |
服务项目 |
内容说明 |
价格 |
周期 |
ATS-F01 |
细菌16S rDNA菌种鉴定 |
16S rDNA全序列比对分析 |
¥350/样品 |
1-2周* |
ATS-F02 |
细菌16S rDNA菌种鉴定 |
16S rDNA全序列扩增,克隆测序,比对分析 |
¥800/样品 |
2周 |
*价格不含DNA提取费用,如果样品多或者特殊,时间协商。 |
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